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Retrovirus e replicazioni virali

Retrovirus e replicazioni virali

RETROVIRUS: Rna ss diploide, involucro. Comprendono 3sottofamiglie(7generi): Spumavirinae, Oncovirinae(tumore mammario, HTLV per leucemia/linfoma a cellule T), Lentivirinae(HIV1-2)

3 geni essenziali per replicazione: gag(proteine strutturali del core), pol(trascrittasi inversa, endonucleasi/integrasi), env(pericapside). Agli estremi dell’Rna sono presenti 2sequenze ripetute R e più internamente, ai rispettivi estremi U5 e U3 (5’-R-U5-gag-pol-env-U3-R-3’). Le sequenze U sono retro trascritte ad ambedue gli estremi cosi che il cDna(-) che si forma si trova ad avere: 5’-U3/R/U5-gag-pol-env-U3/R/U5-3’; U3/R/U5 rappresenta il long terminal repeat che contiene il promotore e l’enhancer per la trascrizione del provirus. 




La trascrittasi inversa(Dna polimerasi Rna dipendente; non essendo una vera e propria polimerasi non c’è l’attività di correttore di bozze da cui l’insorgenza di errori che determinano la variabilità del virus), quindi a partire dall’Rna trascrive una molecola di cDna(-) che va a legarsi alla regione U5-R. Questa viene degradata dall’attività Rnasi H della trascrittasi inversa; il primer giunge fino all’estremità 3’ del genoma virale e si crea un ibrido(Rna/Dna); l’Rna viene spiazzato dalla trascrittasi stessa così che può completarsi una molecola di Dna bicatenario; questo si integra nel genoma della cellula ospite e qui può rimanere silente o essere trascritto in un mRna funzionale. 



REPLICAZIONE VIRUS A RNA:

1. Genoma monocatenario, non segmentato a polarità positiva(astro-, calici-, picorna-, corona-, flavi-,toga virus):  ha la stessa polarità dell’mRNA(+) e può funzionare immediatamente da tale nella cellula infettata.


2. – Genoma negativo non segmentato(paramyxo-, filo-, arena virus): trascrittasi virale(RNA polimerasi RNA dipendente) trascrive un mRNA(+) e viene inglobata nel virione neoformato.    – Genoma negativo segmentato(orthomyxo-, bunya virus): trascrittasi sintetizza mRNA(+) da ciascun segmento, ma ha bisogno di un derivato della polimerasi II cellulare che funga da innesco e per questo avviene nel nucleo.


3. Genoma monopartito ma diploide: Trascrittasi inversa dei retrovirus.

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